Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl3Q6W5C0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms