Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp8b3Q6UQ17 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp8b3Q6UQ17 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms