Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cd300lfQ6SJQ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cd300lfQ6SJQ7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms