Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc82Q6PG04 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc82Q6PG04 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms