Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rad54bQ6PFE3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rad54bQ6PFE3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms