Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vstm2lQ6PDS0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms