Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Mfsd13aQ6PDE8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms