Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slf2Q6P9P0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slf2Q6P9P0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slf2Q6P9P0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms