Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rrp12Q6P5B0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rrp12Q6P5B0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms