Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam222bQ6P539 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam222bQ6P539 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms