Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PrimpolQ6P1E7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrimpolQ6P1E7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PrimpolQ6P1E7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms