Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ptpdc1Q6NZK8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ptpdc1Q6NZK8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ptpdc1Q6NZK8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms