Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZA9

Taf9b, Transcription initiation factor TFIID subunit 9B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf9bQ6NZA9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Taf9bQ6NZA9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Taf9bQ6NZA9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms