Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Szrd1Q6NXN1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Szrd1Q6NXN1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms