Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc66Q6NS45 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc66Q6NS45 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms