Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cep78Q6IRU7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cep78Q6IRU7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms