Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Otud6aQ6IE21 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Otud6aQ6IE21 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms