Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KdsrQ6GV12 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KdsrQ6GV12 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms