Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Smarca2Q6DIC0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Smarca2Q6DIC0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms