Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pram1Q6BCL1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pram1Q6BCL1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms