Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdc5lQ6A068 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc5lQ6A068 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms