Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sv2cQ69ZS6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms