Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Msl2Q69ZF8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Msl2Q69ZF8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms