Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sptbn2Q68FG2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sptbn2Q68FG2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms