Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpgs2Q66JT5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpgs2Q66JT5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms