Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gja3Q64448 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja3Q64448 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms