Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pou4f3Q63955 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms