Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lcn3Q62471 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lcn3Q62471 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms