Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Supt6hQ62383 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Supt6hQ62383 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms