Protein–RNA interactions for Protein: Q62371

Ddr2, Discoidin domain-containing receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr2Q62371 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ddr2Q62371 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ddr2Q62371 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms