Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SypQ62277 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SypQ62277 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SypQ62277 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SypQ62277 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SypQ62277 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SypQ62277 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SypQ62277 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SypQ62277 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SypQ62277 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SypQ62277 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SypQ62277 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SypQ62277 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SypQ62277 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SypQ62277 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SypQ62277 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SypQ62277 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SypQ62277 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SypQ62277 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SypQ62277 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SypQ62277 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SypQ62277 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SypQ62277 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SypQ62277 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SypQ62277 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SypQ62277 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SypQ62277 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SypQ62277 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms