Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Rbm38Q62176 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rbm38Q62176 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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