Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim27Q62158 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim27Q62158 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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