Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hes3Q61657 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hes3Q61657 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms