Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fscn1Q61553 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fscn1Q61553 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fscn1Q61553 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fscn1Q61553 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Fscn1Q61553 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Fscn1Q61553 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Fscn1Q61553 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Fscn1Q61553 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Fscn1Q61553 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Fscn1Q61553 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fscn1Q61553 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fscn1Q61553 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms