Protein–RNA interactions for Protein: Q61249

Igbp1, Immunoglobulin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igbp1Q61249 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igbp1Q61249 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igbp1Q61249 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.4 ms