Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Clns1aQ61189 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Clns1aQ61189 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clns1aQ61189 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clns1aQ61189 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clns1aQ61189 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Clns1aQ61189 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Clns1aQ61189 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Clns1aQ61189 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Clns1aQ61189 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Clns1aQ61189 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Clns1aQ61189 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clns1aQ61189 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms