Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinQ61043 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NinQ61043 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NinQ61043 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinQ61043 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinQ61043 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinQ61043 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinQ61043 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NinQ61043 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinQ61043 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinQ61043 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinQ61043 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NinQ61043 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinQ61043 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinQ61043 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinQ61043 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinQ61043 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinQ61043 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinQ61043 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinQ61043 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NinQ61043 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinQ61043 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinQ61043 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinQ61043 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinQ61043 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NinQ61043 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinQ61043 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinQ61043 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinQ61043 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinQ61043 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinQ61043 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NinQ61043 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NinQ61043 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinQ61043 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinQ61043 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinQ61043 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinQ61043 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinQ61043 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinQ61043 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinQ61043 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NinQ61043 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NinQ61043 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NinQ61043 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NinQ61043 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinQ61043 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinQ61043 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinQ61043 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NinQ61043 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms