Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klf3Q60980 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf3Q60980 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms