Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Laptm4aQ60961 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Laptm4aQ60961 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms