Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Cep250Q60952 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cep250Q60952 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms