Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vdac1Q60932 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vdac1Q60932 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms