Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf8Q60846 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf8Q60846 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms