Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot7Q60809 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot7Q60809 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot7Q60809 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms