Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klf4Q60793 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf4Q60793 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf4Q60793 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms