Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rasa3Q60790 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rasa3Q60790 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms