Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Stxbp3Q60770 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Stxbp3Q60770 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms