Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atf3Q60765 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atf3Q60765 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atf3Q60765 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms