Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epha1Q60750 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epha1Q60750 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms