Protein–RNA interactions for Protein: Q60714

Slc27a1, Long-chain fatty acid transport protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a1Q60714 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc27a1Q60714 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc27a1Q60714 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc27a1Q60714 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms